चीनी वैज्ञानिकों के नेतृत्व वाली एक टीम ने जर्नल सेल में पहले ऐसे त्रि-आयामी स्थानिक-अस्थायी कोशिकीय एटलस को प्रकाशित किया है, जो चावल के पूरे जीवन चक्र— अंकुरित बीज से लेकर फूल आने और दाना भरने तक— को कवर करता है। इसके अलावा, शोधकर्ताओं ने वैश्विक वैज्ञानिक समुदाय के लिए चावल के एकल-कोशिका डेटा पर आधारित एक पोर्टल और मॉडल प्रदान किया है।
'ए स्पैटियोटेम्पोरल लाइफसाइकिल एटलस डिकोड्स स्पेटियल कोऑर्डिनेशन इन राइस' शीर्षक वाला यह लेख 6 अक्टूबर की शाम को ऑनलाइन पोस्ट किया गया था। संबंधित संस्थान साउथ यूनिवर्सिटी ऑफ साइंस एंड टेक्नोलॉजी है, और प्रकाशन के लिए जिम्मेदार लेखकों में प्रोफेसर हुनवेई गुओ शामिल हैं। इन विश्वविद्यालयों और BGI के आंकड़ों के अनुसार, सहयोग नेशनल लैबोरेटरी ऑफ याझोउवान, BGI रिसर्च, हुआचुन एग्रीकल्चरल यूनिवर्सिटी, उहान यूनिवर्सिटी और चाइनीज एकेडमी ऑफ साइंसेज के जेनेटिक्स एंड बायोलॉजिकल डेवलपमेंट इंस्टीट्यूट के साथ किया गया था।
यह एटलस BGI द्वारा जापानी किस्म जूनहुआ 11 पर किए गए सिंगल-न्यूक्लियस आरएनए सीक्वेंसिंग और स्टीरियो-seq स्पेसियल ट्रांसक्रिप्टोमिक्स को एक नए पूर्ण जीनोम संदर्भ जीनोम के साथ मिलाकर बनाया गया था। यह 61 चरणों में 10 प्रकार के अंग और ऊतकों को कवर करता है। डेटा लगभग 851,725 नाभिकों और 347,640 स्थानिक कोशिकाओं को प्रोफाइल करता है, जिससे 119 प्रकार की कोशिकाओं और 133 उपप्रकारों की पहचान होती है।
व्युत्पन्न विकास पथ प्रारंभिक भ्रूण से परिपक्व अंगों तक कोशिकाओं की अवस्थाओं को जोड़ता है। चयनकर्ता लंबे समय से उन जीनों की समस्या का सामना कर रहे थे जो एक विशेषता में सुधार करते थे, लेकिन अन्य को बाधित करते थे। एटलस दिखाता है कि कार्यात्मक जीन विभिन्न ऊतकों और विभिन्न चरणों में ठीक कहाँ कार्य करते हैं। BGI रिसर्च के भागीदारों ने जीन क्वेरी, स्थानिक अभिव्यक्ति देखने और तुलना के लिए राइस स्पैटियो टेम्पोरल एटलस पोर्टल विकसित किया है। RICE scGPT मॉडल, जो एकल-कोशिका डेटा पर आधारित चावल का एक मौलिक मॉडल है, अन्य अध्ययनों में समान पैटर्न वाली कोशिका प्रकारों को एनोटेट करने में मदद करता है।
BGI द्वारा उजागर किए गए परिणामों में, ऑक्सिन प्रतिक्रियाकर्ता OsARF1 नियामक कई विकास शाखाओं से जुड़ा हुआ है, जिनमें मुख्य रूप से विभिन्न अनुमानित लक्ष्य होते हैं, जो मास्टर जीन संपादन के प्रभाव की व्यापकता को प्रदर्शित करता है। स्थानिक मानचित्र बाहरी एंडोस्पर्म में पृष्ठीय और वेंट्रल कार्यक्रमों को भी दर्शाते हैं, जो अनाज भरने के दौरान स्टार्च से जुड़े जीनों या भंडारण प्रोटीन जीनों की ओर निर्देशित होते हैं।
चाइना सेंट्रल टेलीविजन ने आईटी होम का हवाला देते हुए बताया कि यह संसाधन अधिक सटीक प्रजनन डिजाइन को बढ़ावा देगा, जिससे शोधकर्ताओं को व्यापक परिवर्तनों के बजाय संदर्भ-विशिष्ट मॉड्यूल को लक्षित करने की अनुमति मिलेगी। लेखक इस एटलस को चावल के पौधे के कोशिका दर कोशिका कैसे निर्मित होने को समझने के लिए एक पुन: प्रयोज्य आधार के रूप में प्रस्तुत करते हैं।
